Si vous collez vos résultats BLAST (au format text brut bien sûr) dans le formulaire suivant, vous découvrirez un moyen très rapide pour préparer un jeu de séquences au format FASTA avec les noms déjà préformatés:
http://annotathon.org/outils/blast_tax_report2.php

Enjoy:)

Désolé, ça ne fonctionne plus avec la nouvelle présentation de BLAST sans les identifiants "gi"... Je vais explorer pour tenter de trouver une parade...

OK, j'ai trouvé! Il faut cliquer dans la page de résultats BLAST de "Formatting options", puis choisir "Text" à l aplace de HTML et cocher la case  "NCBI-gi", enfi cliquez "Reformat" => ces résultats peuvent être collez dans le formulaire mentionné ci-dessus:
http://annotathon.org/outils/blast_tax_report2.php

Super Pascal...
Concretement vous devez proceder ainsi.
-Faire votre analyse Blastp avec votre ORF favori (modifier eventuellement l'option Max target sequences) pour avoir un nombre important d'homologues et donc une diversité taxonomique la plus large possible de vos homologues.
-Une fois le resultat Blast obtenu (format 'html'), utiliser le bouton 'Formatting Options' pour passer en format 'text', puis eventuellement changer le nombre d'alignement ou de hits de la table, et bouton 'reformat' pour avoir une sortie 'text'.
-Il suffit alors de copier-coller uniquement la liste des Blast Hits
-Cliquez sur rapport taxonomique et le tour est joué..

Bon courage,

ET

Super Pascal...\r\nConcretement vous devez proceder ainsi. \r\n-Faire votre analyse Blastp avec votre ORF favori (modifier eventuellement l\'option Max target sequences) pour avoir un nombre important d\'homologues et donc une diversité taxonomique la plus large possible de vos homologues. \r\n-Une fois le resultat Blast obtenu (format \'html\'), utiliser le bouton \'Formatting Options\' pour passer en format \'text\', puis eventuellement changer le nombre d\'alignement ou de hits de la table, et bouton \'reformat\' pour avoir une sortie \'text\'. \r\n-Il suffit alors de copier-coller uniquement la liste des Blast Hits\r\n-Cliquez sur rapport taxonomique et le tour est joué..\r\n\r\nBon courage, \r\n\r\nET

Desole Pascal,

J'avais pas vu ton message..

ET

Bonjour,

L'outil 'TAX_REPORTS' suggere ci-dessous montre pour le moment quelques bugs. En attendant sa mise au point, je vous conseille de revenir à la procedure classique (usage de l'outil ID2FASTA) pour generer les sequences choisis au format fasta.

ET