Bonjour,

Je rencontre un problème pour conclure sur le plus proche parent de mon ORF car, lorsque je regarde l'arbre de phylogénie, mon ORF "correspond" à une branche dont le plus proche parent est le clade des eucaryotes avec des fonctions GMP réductase. De ce fait j'ai un doute lorsque je dis que l'ORF s'intègre parmi ces homologues (est-ce Correct ?) et comment conclure sur le plus proche parent de mon ORF ?
Hypothèse: ca pourrait venir du fait que je n'ai pas de groupe externe mais seulement un groupe d'étude (cellulars organisms)     (est-ce Correct ?) .

Merci d'avance

J'ai essayé de changer certaines séquences pour voir le résultat mais c'est la même chose

Bonjour,

La question de savoir si votre ORF s'intègre ou non parmi les homologues que vous avez choisis est une fausse question et n'a pas de sens. Que veut dire "s'intégrer", par ailleurs est-ce que seules les séquences eucaryotes sont homologues à votre ORF?

Par rapport à votre question "comment conclure sur le plus proche parent de mon ORF" << si l'arbre est non raciné vous ne pouvez pas avoir cette information de manière certaine.

Céline Brochier

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