Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: Plusieurs séquences avec 100% d'identité, 100% de similitude et 0% de gap

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Plusieurs séquences avec 100% d'identité, 100% de similitude et 0% de gap
reneejenni
18 Apr 2011 23:02
Non evaluated contribution
Bonjour,

Quand je fait un blastx contre la banque nr protéique, je trouve plusieurs séquences avec 100% d'identité, 100% de similitude et 0% de gap. Je ne comprend pas pourquoi je n'ai pas q'une seule séquence. Est-ce que ce résultat pourrait s'expliquer par le fait que ma séquence d'ADN génomique code pour différentes protéines.

Merci,
Renée et Jennifer
E_Meglecz_11
19 Apr 2011 8:20
Game master
Bonjour,

Vous avez trouvé des homologues identiques à votre séquence dans deux espèces différents (Burkholderia vietnamiensis, Burkholderia cenocepacia) et pour chacun de ces espèces il y a plusieurs (2 et 4) séquences identiques sont présentes dans la banque nr.

Réfléchissez avant de poser les questions ou des hypothèses:  Si vous trouvez plusieurs séquences dans une banque qui sont IDENTIQUES et qui ont de MÊME FONCTION, est-ce que cela peut dire que votre séquence code pour DIFFÉRENTES protéines?

Emese Meglecz