Pour les blast effectuées sur la banque environnementale de séquences nucléiques (via tblastn: query = séquence protéique & banque =  séquences nucléiques). Si vous détectez des séquences homologues à votre query, ne cherchez pas à récupérer les séquences par la "procédure classique" car vous allez récupérer les séquences nucléiques.
Vous devez "reconstituer des séquences subjects au format fasta" à partir des alignements 2:2., en faisant un copier/coller à des régions des séquences subjects qui donne un alignement significatif (voir ci-dessous).

Céline Brochier

Ex:

>gb|AACY021480438.1|  Marine metagenome 2151527, whole genome shotgun sequence
Length=961

Score =  111 bits (277),  Expect = 3e-23
Identities = 71/184 (38%), Positives = 113/184 (61%), Gaps = 2/184 (1%)
Frame = -3

Query  4    ERYFIREAVKEMLIDEFLEKELRRAGYGGLDIKKTPLGTKVIIFAANPGYVigrggrrir  63
            +R F+++ V    ++EFL +EL   GY G++++ TP+ T++II A     V+G  GRRIR
Sbjct  932  KRKFVQDGVFYAELNEFLMRELAEEGYAGVEVRATPIRTEIIIRATQTQNVLGDKGRRIR  753

Query  64   eltrilerQFGLENPQIDV--QEIKNPYLNAKVQAVRIAQALERGIHFRRAAYSAMRAIM  121
            ELT +++++F      +++  + ++N  L A+ Q   +   L  G+  RRA Y  +R IM
Sbjct  752  ELTSVVQKRFSFPEGGVELYAERVQNKGLCAQAQTESLKYKLIGGLAVRRACYGVLRFIM  573

Query  122  NNGARGVEIRLSGKLTGERAKSVRFYQGYLAKVGNPAETLVSKGYAQALLKLGVIGVKVA  181
             +GA+G E+ +SGKL G+RAK+++F  GY+ K GN AE  V        ++ GVIGV+V
Sbjct  572  ESGAKGAEVTVSGKLRGQRAKAMKFDDGYMIKTGNAAELYVDSAVRHVQMRQGVIGVRVD  393

Query  182  IMPP  185
            IM P
Sbjct  392  IMLP  381

> Mmetagenom
KRKFVQDGVFYAELNEFLMRELAEEGYAGVEVRATPIRTEIIIRATQTQNVLGDKGRRIRELTSVVQKRFSFPEGGVELYAERVQNKGLCAQAQTESLKYKLIGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGAEVTVSGKLRGQRAKAMKFDDGYMIKTGNAAELYVDSAVRHVQMRQGVIGVRVDIMLP