Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Thread subject: choix de domaines

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choix de domaines
matir
17 Feb 2011 9:56
Non evaluated contribution
bonjour,

On a trouvé deux domaines fonctionnels :
IPR004921-Domaine :Terminas 6 (Bacteriophage terminase, large subunit).
IPR010332-Family  :Terminas 5 (ATPase terminase subunit, putative).

Voici: RAW OUTPUT:

-Sequence_1        71C5ABA9B2D418F9 298        HMMPfam        PF06056        Terminase_5        65        121        2.2e-24        IPR010332.

-Sequence_1        71C5ABA9B2D418F9 298        HMMPfam        PF03237        Terminase_6        216        292        4.3e-13        T IPR004921


lequel on doit choisir ? le plus général c\'est à dire Family ?
B_Wirth_11
17 Feb 2011 14:38
Game master
Bonjour,

Regardez bien où ces domaines ont été identifiés dans votre séquence protéique : vérifiez leurs coordonnées.

Qu'en concluez-vous ?

Bon travail,

Bénédicte Wirth