bonjour ,quant  on ne trouve pas de résultats avec les quartes logiciels  :
-interpro
-prosite
-PFAM
-CDD
que peut on conclure.
  

Si vous ne trouvez aucun domaine protéique conservé (INTERPRO/CDD), il ne reste que la recherche d'homologues (BLAST) pour espérer conclure sur l'aspect fonctionnel... Si BLAST ne donne aucun résultat, alors si l'ORF est conséquente (disons > 60AA) vous êtes tombé sur un "ORFan", une séquence codante qui n'avait encore jamais été vue auparavant (concerne tout de même environ un tiers des séquences environnementales)!
Bon courage:)
PS: Préférez l'anglais sur un forum international

Thank's  very  much ;just please  can  you  give  me  more  details  adout:

the condetion that  we  rely  on in  order to  say  that  our protein is :a new proteine or  no  codont protein.thank's

There is no strict condition, it's a little subjective. I'd say that an ORF with less than 100AA, with strictly no conserved domain and not a single homolog in either GENBANK nor ENV databases is potentially a false positive (non coding), whereas the same with over 150 or 200AA (not due to low complexity regions) is starting to look more like an ORFan (coding with no known homolog).