sonia2hayiri
11 Dec 2009 15:04
Contribution: Pas assez limpide |
Bonjour,nous avons choisi de faire un arbre phylogénétique en utilisant comme groupe d'étude les protéobactéries et les autres bactéries comme groupe extérieur.Nous avons effectué des premières recherches avec 20 séquences de protéobactéries et 8 séquences d'autres bactéries.nous avons obtenu un premier arbre dans lequel les g-protéobactéries et les entérobactéries émergeaient au sein des autres bactéries.Nous avons donc élargi nos recherches en ajoutant des séquences pour notre groupe extérieur.Nous avons obtenu un nouvel arbre que nous n'arrivons toujours pas à interpréter.En effet dans ce nouvel on observe l'émergence des entérobactéries et des g-protéobactéries au sein du groupe extérieur.Notre séquence émerge cependant au sein des a-protéobactéries qui se trouvent être plus proche des autres bactéries que des autres protéobactéries.Aurions-nous fait une erreur dans la définition de nos groupes ou dans l'établissemnet de notre arbre?Ou si ce dernier est correct,pourriez-vous nous guider dans l'interprétation de cet arbre?
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ETalla09
12 Dec 2009 11:07
Maître de jeu |
Premiere remarque: G_proteo == Enterobacteries
En regardant votre arbre, deux possibilites: (1) soit votre sequence est effectivement une alpha et dans ce cas, refaites l'analyse en ayant les alpha comme groupe etude; (2) ou bien chossissez les proteo comme G etude ...
ET |
sonia2hayiri
12 Dec 2009 20:51
Contribution non évaluée |
Bonsoir Monsieur,
Comme vous le savez, l'annothaton ferme dans 4 jours, et nous n'avons toujours pas pu envoyer notre troisième séquence pour une première correction. En effet, nous avons un gros problème; d'abord seulement une seule de nous a une connection internet, et pour moi qui ai accès à internet, l'onglet panier ne fonctionne pas. Voici ce qui est écrit lorsque je clique sur "panier" :
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Nous ne pouvons donc pas avancer dans nos travaux. Comment faire??
Cordialement. |