Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: hit et HSP

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hit et HSP
louss_riquet
9 May 2009 9:18
Contribution non évaluée
Loussouarn margot
Riquet élodie

Bonjour,
J'ai cherché de partout à quoi correspondent les hits et les HSP et je n'ai trouvé pas ou alors je n'ai pas compris les explications données par les différents sites webs.
pourriez vous m'expliquer à quoi ils correspondent?

merci
Brochier09
9 May 2009 9:23
Maître de jeu
Bonjour,

Les hits ou HSP correspondent à des alignements locaux significatifs entre une séquence query et une séquence subjet obtenus par BLAST. Pour être significatifs, ces alignements doivent présenter une e-value ou un score supérieur à un seuil qui est définit dans les paramètres du programme BLAST.

Cordialement,

Céline Brochier