bonjour
lors de la construction de notre arbre nous avons été confronté au probleme suivant: nous avons 13% de positions conservés avec comme groupe d'etude les alpha beta et gamma protéobacterie et comme groupe exterieur les epsilon et delta protéobacterie alors que si nous prenons comme groupe d'etude toutes les protreobacteries nous avons 30% de positions conservé. Cependant notre arbre avec alpha beta et gamma  comme groupe d'etude semble respecter la phylogenie établie, alors que l'autre arbre pas du tout.
doit-on privilégier la phylogénie ou les positions conservés?

Merci. De Gerin arnaud et Baudesson camille

Bonjour,

Il faudrait que vous nous donniez plus d'indications. Quelles séquences avez vous choisies dans les deux analyses (fournir cette information comme il est demandé dans les règles du jeu). Sans ces informations il n'est pas possible de voir si vous avez fait une erreur dans la sélection de vos séquences.

Présentez également les deux alignements obtenus.

Cordialement,

Céline Brochier