qu'est ce que le "nettoyage"?
faut il supprimer les zones qui ne sont pas bleu?
Si oui comment procedons nous?
Merci.

re-bonjour,
CALAMARS = DE GERIN Arnaud et BAUDESSON Camille

Bonsoir,

Gblocks est un logiciel qui permet d'éliminer automatiquement d'un alignement les régions où la qualité est mauvaise. Ceci permet de ne conserver que les positions où la qualité de l'alignement est bonne pour faire les reconstructions phylogénétiques (régions indiquées en bleu suite à l'application de Gblocks).
Cependant, il faut faire attention à bien vérifier que Gblocks n'élimine pas trop de positions (il faut donc jouer sur les paramètres du programmes).

Très cordialement,

Céline Brochier