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Alignement avec t coffee |
Emiso
19 Dec 2008 14:43
Contribution non évaluée |
Madame, Monsieur
Je souhaiterais utiliser la méthode d'alm par TCoffee mais je n'y arrive pas.
Pouvez vous s'il vous plait m'expliquer la marche à suivre ?
Sophie Mercati |
Hingamp_BC08
19 Dec 2008 14:47
Maître de jeu |
Suivez les instructions de mon message précédent "Explorer des arbres très rapidement" (forum "Phylogénie"), et cochez juste T-COFFEE au lieu de MUSCLE. Si vous choisissez l'option "All at once" qui vous mène directement à l'arbre, choisissez ensuite l'onglet "3. Alignment" pour voir l'alignement. Ex:
http://www.phylogeny.fr/version2_cgi/alacarte.cgi?workflow_id=a9dc68dbbf5c4ac5f8ba367cd32d6805&tab_index=3 |
Emiso
19 Dec 2008 15:13
Contribution non évaluée |
(Quel onglet 3 : processing ?)
En suivant toutes vos indications nous obtenons :
Sorry, processing error at this step : outputs not found.
Check the input of the program... |
Emiso
19 Dec 2008 15:14
Contribution non évaluée |
(Quel onglet 3 : processing ?)En suivant toutes vos indications nous obtenons : Sorry, processing error at this step : outputs not found. Check the input of the program... |
Hingamp_BC08
19 Dec 2008 16:20
Maître de jeu |
Vous devez avoir une erreur dans les données en entrée? Soit des erreurs de format FASTA, ou des noms de séquence redondants, ou trop de séquences? Faites l'option "Step by step" pour voir les étapes intermédiaires... |