Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: Problème interprétation arbre

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Problème interprétation arbre
dama
19 Dec 2008 14:17
Contribution non évaluée
Madame, Monsieur,

J'ai du mal a interpréter mon arbre, je n'ai aucun groupe extérieur.
Ma séquence ne se niche dans aucun phylum.
Que dois faire ?
Hingamp_BC08
19 Dec 2008 14:42
Maître de jeu
Si vous ne l'avez pas encore fait, tentez d'enrichir l'arbre en diversifiant les séquences des branches les plus proches (dans votre cas par exemple les b-proteobacteria?). Si malgré tous vos efforts, l'ORF ne se niche pas clairement dans une branche, les données ont parlé, ainsi soit-il! Reportez-vous au PDF de phylogénie pour vérifier ce que l'on peut conclure dans ces cas précis.
Emiso
19 Dec 2008 15:16
Contribution non évaluée
J'ai malheureusement déjà enrichie mon arbre, aucun résulats convaicants.
Je conclue donc pour une duplication ?
dama
19 Dec 2008 15:57
Contribution non évaluée
(excusez moi je vous ai déja envoyer ce message, mais je l'ai malencontreusement envoyer du compte de "emiso", je vous le renvois donc pour ne pas vous embrouiller)

J'ai malheureusement déjà enrichie mon arbre, aucun résultats convaicants.
Je conclue donc pour une duplication ?

Excusez moi encore

dama
Hingamp_BC08
19 Dec 2008 18:21
Maître de jeu
Duplication? Reportez-vous au PDF de phylogénie pour vérifier ce que l'on peut conclure dans ces cas précis... Ej j'aimerais comprendre comment vous avez bien pû répondre à partir d'un autre compte que le votre...
dama
19 Dec 2008 19:04
Contribution non évaluée
Parce que je suis chez une copine (qui fait partit du binome "Emiso") et j'ai machinalement répondu sur sa session qui était déjà ouverte. C'est après en recevant le mail sur ma boite mail, que nous nous en sommes aperçu.