ci_co 15 Dec 2008 17:00
Contribution: Pertinent |
Après recherche dans les fiches interpro nous obtenons cela: GO terms Molecular Function: catalytic activity (GO:0003824) Molecular Function: binding (GO:0005488) Biological Process: metabolic process (GO:0008152) Cette fonction moléculaire ne correspond pas à un des éléments de la liste, que devons nous mettre? De plus après recherche dans les fiches d'homologues, le processus biologique est à chaque fois inconnu. Nous avions discuté avec un des étudiants présents lors des TP de bio-informatique qui nous avait suggéré de mettre les annotations suivantes: "Pour la recherche de fonction moléculaire, nous avons choisis "enzyme regulator activity" car il s'agit d'une DNA: une co-enzyme." et "Pour la recherche de processus moléculaire, nous avons regardé dans les fiches des homologues de notre séquence: il est inconnu à chaque fois." Après correction, il semblerais que cela ne corresponde pas. Que mettre alors? Cordialement |
Hingamp_BC08 16 Dec 2008 11:00 Maître de jeu |
Je suis en effet d'accord avec votre correcteur, vous notez vous-même que votre ORF a des homologues de fonctions connues (genre 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase, soit des Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases) donc je pense aussi que vous avez des options dans les termes GO. Dans TOUS LES CAS, justifiez clairement vos choix; c'est vrai aussi que moi non plus je ne comprends pas bien "il s'agit d'une DNA: une co-enzyme."... |