Forum "Fonctions moléculaires & Processus biologiques"

Sujet de discussion: Que mettre ?

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Que mettre ?
ci_co
15 Dec 2008 17:00
Contribution: Pertinent
Après recherche dans les fiches interpro nous obtenons cela:

GO terms Molecular Function: catalytic activity (GO:0003824)
Molecular Function: binding (GO:0005488)
Biological Process: metabolic process (GO:0008152)

Cette fonction moléculaire ne correspond pas à un des éléments de la liste, que devons nous mettre?
De plus après recherche dans les fiches d'homologues, le processus biologique est à chaque fois inconnu.
Nous avions discuté avec un des étudiants présents lors des TP de bio-informatique qui nous avait suggéré de mettre les annotations suivantes:
"Pour la recherche de fonction moléculaire, nous avons choisis "enzyme regulator activity" car il s'agit d'une DNA: une co-enzyme."
et "Pour la recherche de processus moléculaire, nous avons regardé dans les fiches des homologues de notre séquence: il est inconnu à chaque fois."
Après correction, il semblerais que cela ne corresponde pas. Que mettre alors?

Cordialement
Hingamp_BC08
16 Dec 2008 11:00
Maître de jeu
Je suis en effet d'accord avec votre correcteur, vous notez vous-même que votre ORF a des homologues de fonctions connues (genre 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase, soit des Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases) donc je pense aussi que vous avez des options dans les termes GO. Dans TOUS LES CAS, justifiez clairement vos choix; c'est vrai aussi que moi non plus je ne comprends pas bien "il s'agit d'une DNA: une co-enzyme."...