Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: plus d'alignement homologue groupe externe que groupe d'etude

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plus d'alignement homologue groupe externe que groupe d'etude
levana
25 Nov 2023 19:19
Contribution non évaluée

Bonsoir,

 

Je n'ai trouvé qu'une dizaine de séquences homologues au groupe d'étude, et ai sélectionné une soixantaine de séquences pour mon groupe externe, car même en prenant une seule séquence pour chaque ordre, il y en avait bcp plus. 

Est ce que ca vaut le coup d'avoir autant de séquences pour le groupe externe ou bien je peux réduire ? Quitte à ce que pas tous les ordres du groupe externe ne soient représentés

 

Merci, bonne soirée!

Meglecz23-4CTES
26 Nov 2023 14:07
Maître de jeu

Bonjour,


Vous pouvez sélectionner une vingtaine des séquences pour le groupe extérieur. Faites attention de représenter chaque ordre, mais vous ne devrez pas nécessairement représenter chaque famille au sein des ordres.


Bon travail,
Emese Meglecz