Bonjour,

est ce que le chiffre de word size est important ? j'ai vu que dans vos vidéos vous aviez 6 par défaut, tandis que j'ai 5. Faut il le changer ?

Merci

Levana

Bonjour,

La taille de mot détermine la sensibilité et la vitesse de la recherche de BLAST. En augmentant la taille de mot, la sensibilité (capacité à retrouver des homologues pas trop proches) diminue et la vitesse augmente. Il n’y a pas une énorme différence entre 5 et 6 pour le BLASTp. Vous pouvez laisser la valeur par défaut (5).

Bon travail,
Emese Meglecz