>on nous demande de mettre si nos analyse le permettent un symbole de gène provisoire, de quoi s'agit-il? Comment et où peut-on trouver cette information?

 

Bonjour,

 

pour renseigner le symbole de gène, regardez quelques fiches de séquence issues de Swissprot :

- dans votre résultat brut du blast vs SP, cliquez sur le N° d'accession de la 1ère séq => comme le blast a été fait sur le site du NCBI, la fiche de séq s'ouvre d'abord au format GenBank;

- dans le champ DBSOURCE => UniProtKB, recliquez sur le N° d'accession => vous êtes alors redirigé vers la fiche swissprot correspondante;

- en haut de la fiche, vous avez d'abord le N° d'accession de la séq, puis un champ "Protein", puis un champ "Gene";

- le champ "Gene" est le symbole de gène associé.

 

Ouvrez-ainsi quelques fiches :

- Si le symbole de gène est toujours le même, alors ce symbole est utilisé de manière consensuelle par la communauté scientifique : vous pouvez donc l'utiliser comme symbole de gène pour votre séq étudiée.

- Si le symbole de gène est toujours différent, c'est qu'il n'y a pas encore de consensus pour le nom de gène, dans ce cas, laissez le champ symbole de gène vide.

Le choix du symbole de gène (ou l'absence de choix) doit être justifié dans la conclusion générale du travail.

 

Bon travail,

BW