Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: Définition de la e-value seuil dans NR

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Définition de la e-value seuil dans NR
B_Wirth_23
10 Apr 2023 12:24
Maître de jeu

Question du groupe paunon, Séq Cv2f_10955030.65 :

De même pour notre Balstp contre NR, nous obtenons un résultat surprenant (voir photo) où les valeurs de e-value sont d'abord de 0 puis très petite jusqu'à 3e-51 sachant, qu'ici aussi, la fonction est la même pour nos 1000 séquences ("phosphomannomutase/phosphoglucomutase").

 

Réponse :

Non, votre résultat n’est pas surprenant.

Revoyez ce que nous avons dit en CM et en TP : que signifie une e-value de 0 au début du résultat de blast ?

 

Quelle est votre e-value max ? Et que signifie cette e-value ?

 

Par conséquent, par rapport au rappel dans le message précédent, quelle sera votre e-value seuil ?

 

Bon travail,

BW