Bonsoir,
Phylogénie.fr raccourcie les identifiants de séquences à 64 caractères, pour éviter d’avoir des noms trop longs.
La plus simple sera de raccourcir manuellement les identifiants, avant l’alignement multiple (avant de commencer le travail dans phylogenie.fr)
Par exemple, dans votre cas, vous pouvez remplacer ‘Bacteria-Proteobacteria-Alphaprteobacteria’ par ‘Alpha‘ ou BPA, ou une autre abréviation. Cela va vous permettre de voir le reste des identifiants dans l’arbre.
Vous pouvez aussi enlever les E-valeurs dans le fichier destiné à Phylogenie.fr, mais gardez bien cette information dans la liste des séquences dans la section 'rapport taxonomique' (en dessous de tableau de classification)
Autre solution (moins confortable), c'est de regarder le début des identifiants, car chaque lettre est la première lettre de taxon. Par exemple, dans BPA, B est Bacteria, P est Proteobacteria et A est Alphaproteobacteria. Cette solution n’est pas parfaite, car vous ne pouvez pas distinguer deux taxa de même niveau qui commencent par la même lettre.
Cordialement,
Emese Meglecz