|
Choix de groupe d'étude |
AMIRA
3 Mar 2023 22:27
Contribution non évaluée |
Bonjour
J'ai du mal a choisir mon groupe d'etude ,les homologues appartenant au meme groupe taxonomique sont pas alignés.est ce que ce possible de choisir bacteria proteobacteria et ces classes alpha,gamma,delta).cmt choisir mon groupe d'etude ?est ce que je peux continuer sur cette séquence ou dois je l'abandonner?j'ai pas de chance sur la recherche des sequences .je n'ai pas de doute quant à la fonction de la protéine nombre de hits (5000) obtenus par le Blastp.j'ai testé cet ORF rapide sans rediger nos analyses.
merci
Taxonomy synthesis table
| Classification |
nb lines |
nb hits |
min E-value |
max E-value |
max Score |
min Score |
| LUCA:Bacteria:Kiritimatiellaeota:Kiritimatiellae |
2 |
4 |
7e-154 |
8e-149 |
469 |
456 |
| LUCA:Bacteria:Chlamydiae:Chlamydiia |
39 |
117 |
2e-153 |
3e-88 |
468 |
296 |
| LUCA:Bacteria:Lentisphaerae:Lentisphaeria |
1 |
1 |
2e-144 |
2e-144 |
445 |
445 |
| LUCA:Bacteria:Spirochaetes:Spirochaetia |
84 |
289 |
1e-141 |
1e-91 |
439 |
306 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Oligoflexia |
14 |
36 |
3e-136 |
2e-107 |
424 |
348 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Gammaproteobacteria |
27 |
55 |
8e-121 |
2e-91 |
384 |
305 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Alphaproteobacteria |
78 |
139 |
1e-102 |
3e-85 |
336 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Deltaproteobacteria |
6 |
8 |
8e-102 |
1e-88 |
333 |
298 |
| LUCA:Bacteria:Fibrobacteres:Fibrobacteria |
17 |
36 |
4e-135 |
2e-129 |
421 |
406 |
| LUCA:Bacteria:Fibrobacteres:Chitinivibrionia |
1 |
1 |
4e-122 |
4e-122 |
388 |
388 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Absconditabacteria:Candidatus Absconditabacterales |
1 |
2 |
1e-110 |
1e-110 |
357 |
357 |
| LUCA:Bacteria:Calditrichaeota:Calditrichae |
2 |
4 |
2e-106 |
2e-106 |
346 |
346 |
| LUCA:Bacteria:Ignavibacteriae:Ignavibacteria |
1 |
1 |
3e-105 |
3e-105 |
342 |
342 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Kryptonia:Candidatus Kryptobacter |
1 |
2 |
2e-101 |
2e-101 |
332 |
332 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Kryptonia:Candidatus Thermokryptus |
1 |
2 |
2e-100 |
2e-100 |
330 |
330 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Kryptonia:Candidatus Kryptonium |
1 |
8 |
5e-99 |
5e-99 |
326 |
326 |
| LUCA:Bacteria:Balneolaeota:Balneolia |
9 |
16 |
2e-101 |
1e-93 |
332 |
311 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Clostridia |
493 |
1556 |
2e-101 |
3e-85 |
332 |
289 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Negativicutes |
41 |
80 |
1e-95 |
1e-86 |
317 |
293 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Capillibacterium |
1 |
1 |
6e-92 |
6e-92 |
307 |
307 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Tissierellia |
23 |
59 |
3e-91 |
9e-86 |
305 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Bacilli |
20 |
55 |
4e-90 |
3e-85 |
301 |
289 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Chloroflexia |
8 |
10 |
2e-100 |
4e-94 |
330 |
313 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Anaerolineae |
5 |
10 |
4e-97 |
6e-93 |
321 |
310 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Ardenticatenia |
1 |
3 |
9e-96 |
9e-96 |
317 |
317 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Dehalococcoidia |
6 |
21 |
2e-93 |
3e-91 |
310 |
305 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Thermoflexia |
1 |
2 |
1e-90 |
1e-90 |
304 |
304 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Caldilineae |
2 |
3 |
1e-89 |
8e-88 |
301 |
296 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Actinobacteria |
1138 |
3157 |
7e-100 |
3e-85 |
328 |
289 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Acidimicrobiia |
3 |
6 |
6e-97 |
1e-93 |
320 |
311 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Rubrobacteria |
2 |
3 |
7e-95 |
5e-93 |
315 |
310 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Nitriliruptoria |
1 |
1 |
1e-89 |
1e-89 |
301 |
301 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Thermoleophilia |
2 |
3 |
6e-88 |
1e-85 |
296 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Saccharibacteria:Candidatus Nanosyncoccalia |
2 |
4 |
3e-98 |
3e-92 |
322 |
307 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Saccharibacteria:Candidatus Saccharimonadia |
2 |
4 |
3e-95 |
4e-93 |
319 |
308 |
| LUCA:Bacteria:Rhodothermaeota:Rhodothermia |
6 |
11 |
2e-96 |
4e-86 |
320 |
292 |
| LUCA:Bacteria:Chlorobi:Chlorobia |
14 |
31 |
2e-96 |
3e-90 |
320 |
303 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Rhodothermaceae |
9 |
51 |
1e-95 |
2e-92 |
317 |
308 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Saprospiria |
9 |
16 |
6e-94 |
2e-88 |
313 |
298 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Cytophagia |
63 |
104 |
7e-93 |
3e-85 |
310 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Flavobacteriia |
281 |
657 |
2e-92 |
3e-85 |
310 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Sphingobacteriia |
33 |
60 |
3e-91 |
2e-85 |
306 |
291 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Bacteroidia |
48 |
134 |
8e-91 |
3e-85 |
305 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Chitinophagia |
6 |
11 |
1e-90 |
3e-85 |
305 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Candidatus Sulfidibacteriales |
1 |
2 |
4e-86 |
4e-86 |
292 |
292 |
| LUCA:Bacteria:Dictyoglomi:Dictyoglomia |
1 |
3 |
5e-95 |
5e-95 |
314 |
314 |
| LUCA:Bacteria:Deinococcota:Deinococci |
9 |
15 |
3e-92 |
1e-85 |
308 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Thermotogae:Thermotogae |
5 |
8 |
3e-92 |
8e-91 |
308 |
304 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Cloacimonetes:Candidatus Syntrophosphaera |
1 |
2 |
1e-91 |
1e-91 |
306 |
306 |
| LUCA:Bacteria:bacterium TM473 |
1 |
1 |
5e-90 |
5e-90 |
302 |
302 |
| LUCA:Bacteria:Cyanobacteria:Cyanophyceae |
5 |
6 |
3e-87 |
3e-85 |
295 |
290 |
| LUCA:Bacteria:Cyanobacteria:Adonisia |
1 |
1 |
4e-87 |
4e-87 |
286 |
286 |
| LUCA:Bacteria:Planctomycetes:Planctomycetia |
2 |
3 |
1e-86 |
1e-86 |
294 |
293 |
| LUCA:Bacteria:Fusobacteria:Fusobacteriia |
2 |
4 |
1e-86 |
6e-86 |
293 |
291 |
| LUCA:Eukaryota:Amoebozoa:Evosea |
5 |
10 |
2e-113 |
4e-92 |
364 |
308 |
| LUCA:Eukaryota:Amoebozoa:Discosea |
1 |
2 |
9e-107 |
9e-107 |
342 |
342 |
| LUCA:Eukaryota:Metazoa:Chordata |
230 |
447 |
4e-109 |
2e-86 |
357 |
294 |
| LUCA:Eukaryota:Metazoa:Spiralia |
16 |
37 |
3e-108 |
1e-93 |
354 |
313 |
| LUCA:Eukaryota:Metazoa:Ecdysozoa |
91 |
129 |
2e-106 |
7e-86 |
350 |
293 |
| LUCA:Eukaryota:Fungi:Dikarya |
24 |
52 |
5e-102 |
5e-87 |
341 |
297 |
| LUCA:Eukaryota:Viridiplantae:Streptophyta |
61 |
119 |
1e-100 |
2e-89 |
333 |
302 |
| LUCA:Eukaryota:Metazoa:Cnidaria |
2 |
2 |
3e-100 |
1e-98 |
332 |
327 |
| LUCA:Eukaryota:Sar:Stramenopiles |
2 |
4 |
6e-100 |
7e-87 |
330 |
295 |
| LUCA:Eukaryota:Fungi:Fungi incertae sedis |
1 |
2 |
4e-93 |
4e-93 |
312 |
312 |
| LUCA:Eukaryota:Sar:Alveolata |
4 |
8 |
3e-93 |
5e-88 |
311 |
298 |
| LUCA:Eukaryota:Haptista:Haptophyta |
1 |
2 |
2e-92 |
2e-92 |
310 |
310 |
| LUCA:Eukaryota:Choanoflagellata:Craspedida |
1 |
2 |
2e-85 |
2e-85 |
291 |
291 |
| LUCA:other sequences:artificial sequences |
1 |
2 |
1e-102 |
1e-102 |
339 |
339 |
| LUCA:Archaea:Euryarchaeota:Stenosarchaea group |
1 |
2 |
1e-91 |
1e-91 |
305 |
305 |
|
Meglecz23CTES
5 Mar 2023 11:25
Maître de jeu |
Bonjour,
C’est un cas difficile. En effet les meilleurs E-valeurs de plusieurs phyla bactériennes sont assez proches ce qui ne vous permettre pas à délimiter un groupe d’étude facilement.
Il y a trois solutions (chacune est peu satisfaisante) :
1. Si vous faites une recherche dans NCBI taxonomy (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy), vous pouvez trouver que les premiers phyla dans le tableau font partie de PVC group (superphylum). Regardez si ce superphylum peut être le groupe d’étude. Comme le différentiel des meilleurs E-valeurs reste quand même faible, ce n’est probablement pais la meilleure solution, mais vous pouvez la tenter quand même.
2. Vous pouvez tenter élargir le groupe d’étude aux bactéries. Ceci peut être compliqué, car vous devez aligner des séquences phylogénétiquement éloignées, mais vous pouvez tenter.
3. Vous pouvez abandonner cette séquence. Évidemment c’est frustrant :(
Bon courage,
Emese Meglecz
|
noapardo
31 Mar 2023 2:36
Contribution non évaluée |
Bonjour,
Au vue de mes résultats, est ce judicieux de choisir comme groupe d'étude les Blastocatellia, en supposant que la première ligne est inclue en fait dans la classe Blastocatellia puisque le e-val min est très proche (e-93 et e-96) ?
En vous remerciant par avance pour votre aide,
Bien cordialement,
| Classification |
nb lines |
nb hits |
min E-value |
max E-value |
max Score |
min Score |
| LUCA:Bacteria:Acidobacteria |
2 |
111 |
3,00E-96 |
2,00E-72 |
295 |
235 |
| LUCA:Bacteria:Acidobacteria:Blastocatellia |
4 |
19 |
9,00E-93 |
2,00E-77 |
286 |
247 |
| LUCA:Bacteria:Acidobacteria:Acidobacteriia |
27 |
97 |
8,00E-91 |
4,00E-68 |
281 |
224 |
| LUCA:Bacteria:Acidobacteria:Vicinamibacteria |
1 |
1 |
3,00E-81 |
3,00E-81 |
257 |
257 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria |
2 |
31 |
1,00E-90 |
2,00E-62 |
281 |
208 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Gammaproteobacteria |
73 |
150 |
3,00E-88 |
4,00E-57 |
275 |
195 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Alphaproteobacteria |
1521 |
5161 |
1,00E-87 |
1,00E-56 |
273 |
194 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Betaproteobacteria |
186 |
479 |
5,00E-84 |
1,00E-57 |
264 |
196 |
| LUCA:Bacteria:Proteobacteria:Candidatus Lambdaproteobacteria |
1 |
2 |
2,00E-78 |
2,00E-78 |
249 |
249 |
| LUCA:Bacteria:Deinococcota:Deinococci |
7 |
12 |
3,00E-90 |
1,00E-56 |
280 |
194 |
| LUCA:Bacteria:Planctomycetes:Planctomycetia |
43 |
187 |
9,00E-90 |
2,00E-68 |
278 |
224 |
| LUCA:Bacteria:Planctomycetes |
1 |
26 |
1,00E-86 |
1,00E-86 |
271 |
271 |
| LUCA:Bacteria:Planctomycetes:Phycisphaerae |
4 |
8 |
1,00E-79 |
3,00E-78 |
252 |
249 |
| LUCA:Bacteria:Planctomycetes:Planctomycetes bacterium Pan216 |
1 |
1 |
4,00E-73 |
4,00E-73 |
236 |
236 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Anaerolineae |
5 |
37 |
1,00E-87 |
5,00E-60 |
273 |
202 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi |
4 |
50 |
4,00E-87 |
4,00E-69 |
272 |
226 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Caldilineae |
2 |
4 |
5,00E-82 |
2,00E-80 |
259 |
255 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Chloroflexia |
5 |
6 |
6,00E-81 |
2,00E-76 |
256 |
244 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Ktedonobacteria |
1 |
1 |
3,00E-78 |
3,00E-78 |
249 |
249 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Dehalococcoidia |
1 |
1 |
2,00E-77 |
2,00E-77 |
247 |
247 |
| LUCA:Bacteria:Chloroflexi:Thermoflexia |
1 |
1 |
3,00E-73 |
3,00E-73 |
236 |
236 |
| LUCA:Bacteria:Spirochaetes:Spirochaetia |
24 |
94 |
3,00E-87 |
1,00E-56 |
272 |
194 |
| LUCA:Bacteria:Spirochaetes |
5 |
15 |
8,00E-80 |
4,00E-60 |
253 |
203 |
| LUCA:Bacteria:candidate division KSB1 |
1 |
17 |
5,00E-87 |
5,00E-87 |
271 |
271 |
| LUCA:Bacteria:Deferribacteres:Deferribacteres |
1 |
2 |
8,00E-87 |
8,00E-87 |
271 |
271 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Vecturithrix |
1 |
1 |
1,00E-85 |
1,00E-85 |
268 |
268 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Cytophagia |
33 |
53 |
3,00E-85 |
1,00E-58 |
267 |
199 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes |
1 |
17 |
2,00E-84 |
2,00E-84 |
265 |
265 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Chitinophagia |
16 |
36 |
1,00E-83 |
2,00E-65 |
263 |
217 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Saprospiria |
2 |
12 |
3,00E-82 |
7,00E-64 |
259 |
212 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Sphingobacteriia |
23 |
38 |
4,00E-82 |
1,00E-66 |
259 |
219 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Bacteroidia |
30 |
72 |
1,00E-80 |
2,00E-57 |
255 |
196 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Flavobacteriia |
37 |
68 |
7,00E-80 |
2,00E-57 |
253 |
196 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Rhodothermaceae |
2 |
17 |
2,00E-78 |
2,00E-65 |
249 |
216 |
| LUCA:Bacteria:Bacteroidetes:Bacteroidetes Order II. Incertae sedis |
1 |
1 |
4,00E-65 |
4,00E-65 |
216 |
216 |
| LUCA:Bacteria:Atribacterota: TPA |
1 |
9 |
8,00E-85 |
8,00E-85 |
266 |
266 |
| LUCA:Bacteria:Atribacterota |
2 |
2 |
7,00E-78 |
7,00E-67 |
246 |
215 |
| LUCA:Bacteria |
4 |
31 |
9,00E-85 |
6,00E-60 |
266 |
202 |
| LUCA:Bacteria:Thermodesulfobacteria:Desulfobacteria |
3 |
4 |
2,00E-84 |
2,00E-73 |
265 |
237 |
| LUCA:Bacteria:Thermodesulfobacteria:Desulfobulbia |
7 |
14 |
5,00E-82 |
8,00E-70 |
259 |
228 |
| LUCA:Bacteria:Thermodesulfobacteria:Desulfovibrionia |
19 |
33 |
8,00E-80 |
5,00E-64 |
253 |
213 |
| LUCA:Bacteria:Balneolaeota:Balneolia |
23 |
53 |
3,00E-84 |
1,00E-63 |
264 |
212 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Actinobacteria |
9 |
29 |
4,00E-84 |
3,00E-69 |
264 |
226 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Actinobacteria bacterium |
1 |
2 |
7,00E-76 |
7,00E-76 |
241 |
241 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Acidimicrobiia |
3 |
25 |
6,00E-77 |
3,00E-71 |
246 |
231 |
| LUCA:Bacteria:Actinobacteria:Nitriliruptoria |
4 |
6 |
2,00E-74 |
2,00E-60 |
239 |
203 |
| LUCA:Bacteria:Deltaproteobacteria |
2 |
36 |
4,00E-84 |
6,00E-81 |
264 |
256 |
| LUCA:Bacteria:Deltaproteobacteria:SAR324 cluster |
1 |
13 |
9,00E-84 |
9,00E-84 |
263 |
263 |
| LUCA:Bacteria:Verrucomicrobia |
1 |
24 |
9,00E-84 |
9,00E-84 |
263 |
263 |
| LUCA:Bacteria:Verrucomicrobia:Opitutae |
5 |
7 |
7,00E-82 |
7,00E-68 |
258 |
223 |
| LUCA:Bacteria:Verrucomicrobia:Verrucomicrobiae |
3 |
5 |
2,00E-77 |
4,00E-72 |
245 |
233 |
| LUCA:Bacteria:Verrucomicrobia:Spartobacteria |
1 |
2 |
4,00E-70 |
4,00E-70 |
229 |
229 |
| LUCA:Bacteria:bacterium M00.F.Ca.ET.230.01.1.1 |
1 |
1 |
2,00E-80 |
2,00E-80 |
255 |
255 |
| LUCA:Bacteria:Calditrichaeota |
1 |
5 |
6,00E-80 |
6,00E-80 |
253 |
253 |
| LUCA:Bacteria:Calditrichaeota:Calditrichae |
1 |
1 |
2,00E-59 |
2,00E-59 |
201 |
201 |
| LUCA:Bacteria:Ignavibacteriae:Ignavibacteria |
2 |
5 |
7,00E-80 |
6,00E-68 |
253 |
223 |
| LUCA:Bacteria:Ignavibacteriae |
1 |
5 |
1,00E-70 |
1,00E-70 |
229 |
229 |
| LUCA:Bacteria:Myxococcota:Polyangia |
5 |
23 |
1,00E-79 |
3,00E-77 |
253 |
247 |
| LUCA:Bacteria:Myxococcota:Myxococcia |
1 |
2 |
2,00E-75 |
2,00E-75 |
242 |
242 |
| LUCA:Bacteria:candidate division KSB3 |
1 |
3 |
1,00E-79 |
1,00E-79 |
253 |
253 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Marinimicrobia |
1 |
6 |
3,00E-79 |
3,00E-79 |
251 |
251 |
| LUCA:Bacteria:Gemmatimonadetes: TPA |
1 |
6 |
4,00E-79 |
4,00E-79 |
251 |
251 |
| LUCA:Bacteria:Gemmatimonadetes:Gemmatimonadetes bacterium T265 |
1 |
1 |
4,00E-75 |
4,00E-75 |
241 |
241 |
| LUCA:Bacteria:Gemmatimonadetes:Gemmatimonadetes |
4 |
5 |
5,00E-75 |
9,00E-67 |
241 |
220 |
| LUCA:Bacteria:bacterium M00.F.Ca.ET.141.01.1.1 |
1 |
1 |
1,00E-77 |
1,00E-77 |
247 |
247 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Latescibacteria |
1 |
1 |
8,00E-76 |
8,00E-76 |
243 |
243 |
| LUCA:Bacteria:bacterium M00.F.Ca.ET.194.01.1.1 |
1 |
2 |
5,00E-74 |
5,00E-74 |
239 |
239 |
| LUCA:Bacteria:Rhodothermaeota:Rhodothermia |
1 |
1 |
1,00E-73 |
1,00E-73 |
238 |
238 |
| LUCA:Bacteria:Chlorobi |
2 |
3 |
7,00E-72 |
1,00E-71 |
233 |
232 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Bacilli |
392 |
927 |
9,00E-70 |
1,00E-56 |
228 |
194 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Clostridia |
9 |
15 |
4,00E-69 |
1,00E-58 |
226 |
199 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota |
4 |
6 |
5,00E-66 |
9,00E-62 |
218 |
207 |
| LUCA:Bacteria:Bacillota:Hydrogenispora |
1 |
2 |
1,00E-59 |
1,00E-59 |
201 |
201 |
| LUCA:Bacteria:Thermotogae:Thermotogae |
3 |
3 |
2,00E-63 |
5,00E-60 |
211 |
202 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Aminicenantes |
1 |
3 |
2,00E-61 |
2,00E-61 |
206 |
206 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Aminicenantes:Candidatus Saccharicenans |
2 |
7 |
1,00E-59 |
2,00E-59 |
201 |
201 |
| LUCA:Bacteria:Candidatus Melainabacteria:Candidatus Obscuribacterales |
1 |
2 |
2,00E-59 |
2,00E-59 |
201 |
201 |
| LUCA:Bacteria:Chlamydiae:Chlamydiia |
1 |
1 |
2,00E-58 |
2,00E-58 |
199 |
199 |
| LUCA:Bacteria:Thermomicrobiota:Thermomicrobia |
1 |
1 |
3,00E-57 |
3,00E-57 |
194 |
194 |
| LUCA:Eukaryota:Metazoa:Ecdysozoa |
1 |
7 |
4,00E-84 |
4,00E-84 |
264 |
264 |
| LUCA:Eukaryota:Sar:Alveolata |
1 |
1 |
9,00E-67 |
9,00E-67 |
234 |
234 |
| LUCA:Eukaryota:Viridiplantae:Streptophyta |
1 |
1 |
3,00E-65 |
3,00E-65 |
216 |
216 |
| LUCA:Eukaryota:Fungi:Dikarya |
1 |
1 |
2,00E-59 |
2,00E-59 |
201 |
201 |
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Meglecz23CTES
31 Mar 2023 17:57
Maître de jeu |
Bonjour,
On n’a aucune indication que les séquences de première lige soient des Blastocatellia, donc votre choix ne me semble pas justifié. De plus. Même si on était sûrs que ces séquences soient le Blastocatellia, le différentiel de l’ordre de grandeur entre 3,00E-96 et 8,00E-91 n’est que 5. C’est assez faible.
Je vous conseille d’élargir le groupe d’étude.
Bon travail,
Emese Meglecz
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