Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: modification arbre et analyse

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modification arbre et analyse
Anissa
28 May 2022 19:08
Contribution non évaluée

Bonjour Madame, 

 

Au vu de vos commentaires, j'ai décidé de refaire un arbre. J'ai replacé la séquence des rickettsiales dans le groupe d'étude. Je ne comprend pas pourquoi la valeur de boostrap n'a pas changé. Pouvez-vous m'expliquer ?

Après des recherches j'ai compris que ma conclusion sur l'ORF pouvait être modérée mais la valeur de bootstrap n'a-t-elle pas une influence sur le classement final de l'ORF ?

Je ne sais pas si c'est très compréhensible.

 

Cordialement, 

DELANOUE Anissa

Meglecz21CTES
29 May 2022 18:14
Maître de jeu

Bonjour Anissa,

 

Tout d’abord il faut analyser la topologie de l’arbre. Les conclusions qui dérivent de la topologie peuvent être plus ou moins soutenues par valeurs de robustesse.

Que voulez-vous dire par ‘refaire un arbre’ ? J’ai suggéré de changer le placement de la racine de l’arbre actuelle. Cela ne devrait pas changer les valeurs de robustesse, car vous avez bien le même arbre, seulement la racine est placée sur une branche différente.

 

Bon travail,
Emese Meglecz