Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: Gene Ontology et synonyme

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Gene Ontology et synonyme
AshleyRusso
18 Apr 2022 16:15
Contribution non évaluée

Bonjour Mme Meglecz, 

 

Je me permets de vous écrire car j'ai finalement choisi l'annotation d'une autre séquence que celle précedemment évoquée, qui n'avait rien donné sur SwissProt. 

 

Je m'interroge sur l'interprétation que je pourrai donner concernant les fonctions et le détail sur Gene Ontology. 

 

Sur la base NR, la fonction majoritaire est "deoxyribodipyrimidine photo-lyase (activity)", avec pour définition sur GO : Catalysis of the reaction: cyclobutadipyrimidine (in DNA) = 2 pyrimidine residues (in DNA). This reaction represents the reactivation of irradiated DNA by light. 

 

Sur la base SwissProt, je retrouve à quasi parts égales "Full=Deoxyribodipyrimidine photo-lyase" (qui me laisse penser à une homologie), et "Full=Cryptochrome", avec pour définition "full support of intron positions by RNA-sequencing alignment". 

 

Que pourrai-je conclure ? 

 

En vous remerciant par avance pour votre aide. 

 

Bien cordialement, 

 

Mme RUSSO Ashley 

Meglecz21CTES
18 Apr 2022 16:35
Maître de jeu

Bonjour Ashley,

 

Je ne comprends pas le problème. Les différentes fonctions me semblent cohérentes.

 

“full support of intron positions by RNA-sequencing alignment" n’est pas une fonction. Le message indique que les positions des introns ont été confirmées par séquençage d’ARN.

 

Cordialement,
Emese Meglecz