Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: Définition de la fonction d'un ORF

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Définition de la fonction d'un ORF
MaeBinaud
31 Mar 2022 16:48
Contribution non évaluée

Bonjour,

 

Les fonctions attribuées aux hits que je trouve pour l'ORF3 n'ont pas du tout le même nom dans swissprot et dans NR. Or quand je regarde sur QuickGO je ne trouve aucun synonymes. Ce n'est pas la première séquence pour laquelle ça me fait ça je ne sais pas trop comment faire et me retrouve un peu bloquée.

Dois je changer de séquence ? ( c'est ce que j'ai fait la première fois que j'ai rencontré ce problème mais je me retrouve finalement dans la même situation)

 

Merci d'avance pour votre aide,

Maë Binaud.

MaeBinaud
31 Mar 2022 16:57
Contribution non évaluée

Cependant, je viens de remarquer que le schéma en haut de page des 2 BLAST indique la même fonction...

 

Blastp NR

 

Blastp SP

 

MaeBinaud
31 Mar 2022 17:29
Contribution non évaluée

Après avoir consulté la fiche swissprot des différents hits je pense pouvoir avancer. :)

 

Meglecz21CTES
31 Mar 2022 20:13
Maître de jeu

:)