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Sujet de discussion: MSA de spike montrant l'insertion de FCS dans SC2

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MSA de spike montrant l'insertion de FCS dans SC2
manonmtz30
18 Oct 2021 23:20
Contribution non évaluée

 

Bonsoir monsieur, 

Voici mon MSA de spike montrant l'insertion de FCS dans SC2 

Cordialement 

 

 

 

agraince
19 Oct 2021 23:41
Contribution non évaluée

                                                     [FSC]
Sarbecov1     GAEHVD--TSYECDIPIGAGICASYHTV-----S----LL----RSTS--QK----SI--
Sarbecov2     GAEHVN--NSYECDIPIGAGICASYQTQ-----T----NSPRRARSVA--SQ----SI--
Sarbecov3     GAAYDN--SSYECDIPIGAGICAKYTNV-----S----ST----LVRS-GGH----SI--
SARS-coV-2    GAEHVN--NSYECDIPIGAGICASYQTQ-----T----NSPRRARSVA--SQ----SI--
SARS-coV-1    GAEHVD--TSYECDIPIGAGICASYHTV-----S----LL----RSTS--QK----SI--
RaTG13_Vir    GAEHVN--NSYECDIPIGAGICASYQTQ-----T----NS----RSVA--SQ----SI--
SARS1_chau    GAEHVD--TSYECDIPIGAGICASYHTV-----S----SL----RSTS--QK----SI--
Hibecov1_E    GAIQAQ-ENSTECQFALGLDSCVNYTAD-----T----RL----RTARAADR----ALTF
Nobecov1_E    NVELRNTTIVNTCAMPIGNSLCFINGSI-----AT--ANA-----DSL--PR---LQLV-
Nobecov2_E    NVNNCTTHTVSVCEMPIGNSLCLVSNFT-----CS--DVA-----TAS--LSPNLLSLV-
Merbecov1     GFINSS-MVVDECQLPLGQSLCAIPPTT-----SSRVRRA---TSGAS--DV---FQIA-
Merbecov2     GLSNNS-LVVSDCKLPLGQSLCAVPPVS-----TF---RS---YSA----SQ---FQLA-
Merbecov3     GLVNSS-LFVEDCKLPLGQSLCALPDTP-----STLTPRS---VRSVP--GE---MRLA-
Merbecov4     GLVNSS-LFVEDCKLPLGQSLCALPDTP-----STLTPRS---VRSVP--GE---MRLA-
Merbecov5     GFRNTS-DTVEDCTLPLGQSLCAKPPSF-----SS---RS---TN-VN--NT---FALV-
MERS_HUMAI    GLVNSS-LFVEDCKLPLGQSLCALPDTP-----STLTPRS---VRSVP--GE---MRLA-
MERS_chave    GLSNNS-LVVSDCKLPLGQSLCAVPPVS-----T---FRS---YSA----SQ---FQLA-
MERS_chame    GLVNSS-LFVEDCKLPLGQSLCALPDTP-----STLTPRS---VRSVP--GE---MRLA-
BANAL20-52    GAEHVN--NSYECDIPIGAGICASYQTQ-----T----NS----RSVA--SQ----SI--
Embecov1_E    NADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKS-----R----RA---HRSVS--TG---YRLT-
Embecov2_E    NADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKS-----R----RA---DRSVS--TG---YRLT-
Embecov3_E    NADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTK-----R----RS---RRSIT--TG---YRFT-
Embecov4_E    NADNSTASTVQTCDLTVGSGYCVDYSTQ-----L----RS---RRAIT--TG---YRFT-
Embecov5_E    NAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKN-----R----RS---RGAIT--TG---YRFT-
Embecov6_E    NADNSTEHSVDACDLRMGSGLCVNYSTA-----H----RA---RRSVS--TG---YKLT-
Embecov7_E    NADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKS-----R----RA---RRSVS--TG---YRLT-
Embecov8_E    NADDDIAEAVGSCNLTVGSGYCVDYSST-----W----RA---KRDLN--TG---YRLT-
Embecov9_E    NADNLTDYSVSSCALRMGSGFCVDYNSPSSSSSR----RK---RRSIS--AS---YRFV-
OC43-gripp    NAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKN-----R----RS---RRAIT--TG---YRFT-
              .           * : :* . *              .   ***      .       :.