Bonjour,

Vous m'avez fait cette remarque : - Expliquez pourquoi vous avez choisi si peu des séquences de groupe d’étude.

Il n'y a pas de raison, simplement que je pensais avoir assez de séquence ou du moins je ne pensais pas devoir en prendre beaucoup. Cela n'est pas fait exprès, je voulais avoir un peu de séquence de toutes les classes.

Merci cordialement.

Bonjour Sarah,

Extrait de règle du jeu :
Vous utiliserez ces résultats du BLAST pour constituer deux groupes de séquences homologues qui serviront, après alignement multiple, à tenter une reconstruction d'arbre phylogénétique:
•    un groupe d'étude (jusqu'à environ 15-30 séquences) représentant les homologues appartenant au même groupe taxonomique présume pour votre ORF
•    un groupe extérieur (environ 5-20 séquences) représentant les homologues les plus proches n'appartenant pas au groupe d'étude (dans le but d'enraciner l'arbre phylogénétique, lire absolument la FAQ à ce sujet)

Dans certains cas, ça peut être justifié d’avoir moins de séquences, mais avec des arguments solides. «  je pensais avoir assez » n’est pas très convaincant comme argumentation. De plus, en ajoutant plus des séquences il sera peut-être possible d’assigner l’ORF à une des classes de proteobacteria.

Bonne soirée,
Emese Meglecz

Bonjour,

Autant pour moi, j'ai dû sauter cette partie des règle du jeu sans le vouloir.

Merci cordialement