Bonjour, bon j'ai réalisé de multiples manipulations mais je ne sais plus quoi faire éviter que les deux branches de mon groupe ext se retrouvent mélangées a mon groupe d'étude.

D'autre part j'ai remarqué que mon groupe d'étude est trop général donc je pense qu'une partie du problème est due au fait que ma evalue la plus haute est un cluster et non pas une espèce en particulier....

Dois-je tout recommencer et choisir une autre séquence à analyser ?

Cordialement,

Hope

ça me parait difficile en effet, vu que tu as vraiment très peu de hits dans ton groupe extérieur et que tes deux meilleures E-value (de très loin) sont générales. En plus il n'y a pas vraiment de différence entre les e-valeurs de ton groupe d'étude (hormi ces exceptions) et ton groupe extérieur. Et si tu tentais encore Blast contre refseq_proteins au lieu de NR, pour voir si cela améliore ces classements ?

Rebonjour Hope,

Oui, je pense que c’est plus sage de commencer une autre séquence. Regardez les explications ici :
http://annotathon.org/?seeThread=3006

Bon courage,
Emese Meglecz