bonjour ,

j'ai plusieurs questions concernant mon tableau Cf : nouveau tableau

1) en premieu lieu je trouve le plus de amidohydrolase family protein puis des hypothetical protein mais le problème c'est que je peux pas comparer avec alors est ce que je peux prendre la suivante amidohydrolase ?

2) en ce qui concerne quick go j'ai pas bien compris comment on peut voir si c'est la même fonction 

merci pour votre aide

Bonjour Léa,

Le terme ‘Hypotetical protein’ veut dire que la séquence ressemble à une protéine, mais nous n’avons pas de preuve que ça soit vraiment une vraie protéine. Nous ne connaissons pas sa fonction non plus. La présence des homologues hypothétiques ne confirme pas la fonction amidohydrolase, mais il n’ay a pas de contradiction non plus.

Pour QuickGO il n’y a pas vraiment une bonne façon à procéder, car chaque cas est différent. Essayez à trouver la description de chaque type de fonction dans votre tableau et regardez s’ils sont compatibles (ils ont des fonctions similaires). Vous pouvez aussi observer que dans votre tableau la très grande majorité des fonctions avec de très bonne Evaleurs sont d’hydrolases.

Cordialement,
Emese Meglecz