|
Rapport taxonomique |
Ampen-sarah 29 Mar 2021 20:32 Contribution non évaluée |
Bonjour,
J'ai un petit problème pour mon rapport taxonomique.
Pour moi, mon groupe d'étude est celui-ci :
Classification |
nb lines |
nb hits |
min E-value |
max E-value |
Bacteria:Balneolaeota:Balneolia:Balneolales |
2 |
7 |
5e-132 |
7e-131 |
Le soucis est que dans le FAQ (dans la partie "L'arbre de la vie, vu par les microbes"), je ne retrouve pas cette bactérie.
Dois-je prendre un autre groupe d'étude ? Si non, quel serait mon groupe extérieur ?
Merci cordialement
|
AnaisE 29 Mar 2021 21:48 Contribution non évaluée |
|
Meglecz20CTES 30 Mar 2021 17:46 Maître de jeu |
Bonjour Sarah,
Le lien trouvé par Anaïs est très bien. Le Balneolaeota fait partie de groupe FCB. Ce groupe ne fait pas partie de Bacteriodetes, mais c’est un phylum proche.
Par contre, attention! Le meilleur hit a 99% identité avec l'ORF, donc vous ne devriez pas choisir cette séquence pour les analyses.
Cordialement,
Emese Meglecz
|
Ampen-sarah 1 Apr 2021 10:56 Contribution non évaluée |
Bonjour,
Merci beaucoup Anaïs et aussi à vous Mme Meglecz.
Je n'avais pas fait attention, je vais changer ça.
Cordialement
|