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BLAST hit list Definitions nb limite |
AlexTom
23 Mar 2021 13:10
Contribution non évaluée |
Tableau 2 : Catalogue des fonctions des proteines alignées par BLASTp contre NR
| Definitions |
nb lines |
min E-value |
max E-value |
| class II fumarate hydratase |
72 |
0 |
3.00E-145 |
| aspartate ammonia-lyase |
21 |
0 |
3.00E-145 |
| fumarase |
1 |
0 |
0 |
| Fumarate hydratase class II |
2 |
4.00E-151 |
5.00E-148 |
| fumarate hydratase class II |
1 |
3.00E-150 |
3.00E-150 |
| fumarase, fumarate hydratase, class II |
1 |
3.00E-149 |
3.00E-149 |
| fumarase, class II |
2 |
8.00E-147 |
1.00E-146 |
Bonjour Madame,
en comparaison avec votre video ou vous avez + de 1000 nb de ligne mes resultats sont plus petit est ce que cela vous parrait suffisant plus la suite ou devrais-je choisir un autre ORF?
merci
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Meglecz20CTES
23 Mar 2021 13:22
Maître de jeu |
Bonjour Alex,
Je pense que vous avez oublié à choisir 5000 pour l’option Max target sequences dans BLAST.
Bon travail,
Emese Meglecz
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AlexTom
23 Mar 2021 22:02
Contribution non évaluée |
Oui c'etait bien ça merci
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