Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: tblastn

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tblastn
nimes
22 Apr 2008 18:54
Contribution non évaluée
peut'on utilisé les résultats d'un tblastn pour determiner le score seuil??
Brochier_B08
22 Apr 2008 19:09
Maître de jeu
Bonsoir,

La définition d'un score seuil est spécifique d'une recherche blast. Si vous faites un blastp contre nr, vous allez définir un score seuil. Si vous faites un blastp contre swiss-prot en utilisant la même query, alors il faudra redéfinir un score seuil pour cette recherche (ce score seuil sera certainement différent du score défini pour la recherche précédente car les banques ciblées ne sont pas les mêmes). Donc si vous faites un tblastn il va falloir définir un score seuil spécifique de cette recherche.

Cordialement,

Céline Brochier