Bonjour, nous avons fait un tblastn contre la banque environnementale,
nous savons qu'il faut regarder où ont été prélevé les séquences homologues à notre ORF,
mais nous ne savons pas quel est l'intérêt et quelle conclusion pouvons-nous tirer d'un tel regroupement géographique?

Bonjour,

Un tblastn sur la banque environnementale permet de répondre à plusieurs questions:
- Est-ce que les homologues de mon ORF sont abondants dans l'environnement ?
- Si oui, est-ce qu'elle est abondante dans tous les types d'environnements ?
- Si non, est-ce qu'on la trouve uniquement dans l'endroit que là où mon ORF a été prélevée ?
...

Il y a plein d'information à tirer de l'analyse d'un tblastn

Cordialement,

Céline Brochier