Bonsoir,

Suite à votre suggestion d’éliminer la séquence partielle de mes analyses, mon alignement est maintenant légèrement différent: j’ai un “bloc” de positions conservées entre les positions 45 et 80 et un autre après la position 210. Serait-il possible qu’il s’agisse de deux protéines différentes dans le même ORF ? Ou de deux fonctions différentes de la même protéine ?

J’ai refait le BLASTp également et cela semble donner la même information, qu’une partie de la protéine a une autre fonction et que la deuxième partie uniquement correspond à la fonction que j’ai analysée. Pourtant, dans la description (plus en bas dans les résultats du blast), il n’y a qu’une fonction qui apparait.

Merci et bonne soirée!

Ramona

Je viens de me rendre compte que s'il y avait deux protéines, il y aurait eu un codon stop entre les deux. Mais alors deux fonctions/ parties différentes dela même protéine?

Bonjour Ramona,

Les protéines sont souvent composées des domaines protéiques. Un domaine à sa propre structure tridimensionnelle est responsable pour une fonction. Quand il y a plusieurs domaines protéiques dans la même protéine, ils s’agissent souvent en concert pour pouvoir assurer une fonction plus complexe. Par exemple, un est responsable à la fixation de la protéine à la cible, autre catalyse une réaction.
Votre observation des deux blocs conservés a donc du sens biologique.

Bonne soirée,
Emese Meglecz