Bonjour tous le monde, 

je m'y prend un peu tard, mais j'ai besoin de quelques information. J'ai compris je pense comment trouver les ORF, j'ai réalisé un tableau sur OpenOffice pour mettre tous mes résultats. Je n'arrive pas à mettre mon tableur sur le site d'Annotathon, le site me dit que je ne peut pas copier coller à partir de mon presse papier est ce que quelqu'un aurait la solution ? 

Ensuite, j'ai cherché des homologues par BLAST, j'en est trouvé aucun pour tous mes ORF sauf 1. J'ai du mal pour "classer" les ORF. Il est dit dans les regles que les ORF Know sont des genes codant pour une proteine avec des fonctions connues, alors que les Novel les fonctions sont inconnues. Il faut regarder ou pour savoir si les fonctions sont connues ou non ??.. 

Merci d'avance à tous ! et bon courage ! 

Bonjour Léa,

Si vous avez de problème de copier-coller un tableau à partir de OpenOffice (bizarre), essayez de copier-coller un tableau à partir des Règles de jeux.

Je saurais probablement répondre plus facilement à votre deuxième question en voyant de votre tableau, car pour le moment je ne comprends pas si vous n’avez aucun ORF avec des homologues, ou si vous parlez d’un seul ORF qui a un seul homologue.

Bon travail,
Emese Meglecz

Bonjour Madame, 

j'ai réussi a coller finalement ! 

j'ai mis mon tableau, du coup je me demande où est ce que dans BLAST je peut voir si les fonctions des proteines sont connues ou non. 

J'espere etre assez claire dans ma question, tous ca reste un peu flou pour moi. 

merci d'avance

Bonjour,
Sur la page de BLAST, dans le tableau en dessous où tu vois tes sequences avec les pourcentages d'identités, les E-Valeurs... les homologues avec fonctions  inconnues sont notés <hypotetical> au lieu des noms de fonctions connues.
Bon courage pour la suite

Julie P

Ah, super ! Merci pour la réponse ! 

Bon courage à toi aussi !

Merci pour la réponse de Julie !
Elle a mieux compris la question que moi.
Bon travail,
Emese Meglecz