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Taxonomy report et list report apres Blast |
GRP1_SMAINI
28 Feb 2018 11:01
Contribution non évaluée |
Je n'arrive pas à faire fonctionner le taxonomy list pour cette sequence: (le format semble etre faux)
TSDRLNQLGIHSLEHLIFHLPSRYQDKTSITQLSDAKISDESLIEASIDRIEVIPSRHRQLLCYLSDNQNHRILLRFFHFNQYQKQAFVRGETIQCFGEI
KVGREGLEMHHPEYRLITQEQKPLLESTLSPIYPLCSGVTQAKMKKWVNEALEALNTSIIDDYFEKIINNTMPSLKDSLFLLHHPKQGENLSKIESFTHI
SQQRLIIEELATHQLSLLKIKSARKSKKTTAFSINHSLSDKLLKSLDFQLTKAQNRSIEEINKDIASSNPMLRLLQGDVGSGKTIVAVFALLQAVENNFQ
TAVMAPTEILARQHLQS
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A_Haudry_18
28 Feb 2018 12:23
Maître de jeu |
BLAST taxonomic report
Follow the instructions on the TaxReports tool to extract taxonomic information from your list of BLASTp hits.
Copy the full BLAST Lineage Report in the Annotathon 'Taxonomy report' 'Raw results" field. Only include the first chapter called Lineage Report.
DO not use the sequence, but the blast results
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GRP1_DELPUECH
1 Mar 2018 9:44
Contribution non évaluée |
Il faut que tu clique sur "plain text" dans formatting option, sans aller dans taxonomie report. tu copie-colle ta liste de séquences données par blast , tu verras ça marchera, cela va te la trier selon la philogénie automatiquement.
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GRP1_SMAINI
1 Mar 2018 10:29
Contribution non évaluée |
Merci pour vos réponses! effectivement il fallait d'abord passer dans plain text dans formatting options et faire reformat avant de coller les sequences dans taxreport
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