Bonjour, nous tentons de définir un seuil de e-value pour la recherche d'homologues avec NR (tronqué à 5000), or la e-value la plus élevée est de l'ordre de 1e-52 et nous n'observons ni saut de e-value ni changement de fonction (nous retrouvons des transporteurs ABC jusqu'à la fin de notre BLAST). Comment pouvons-nous déterminer un seuil cohérent?
Merci d'avance

Bonjour,

Dans le cas d'un rapport BLAST tronqué à 5000 hits dont le dernier est toujours à 1e-52, il est clair qu'on n'a aucne idée où se situe exactement le seuil. Tout ce que vous pouvez (et devez) dire, c'est que ce seuil est supérieur à 1e-52 (dans votre cas >>1e-52) car il est très probable qu'il reste énormément de hits au delà des 5000 premiers de votre listing...