B_Wirth_12 20 May 2012 12:36 Maître de jeu |
Re-Bonjour,
Mais pour information : Correction 2 : - ORF : Bien - PM : OK, mais 1 erreur - Domaine : Bien - Blast : Manque description des 10 1ers alignements et donc la discusson start/stop, Manque la conclusion et seuil trop élevé (mais soit) - Rapport taxo : FAUX => groupe d'étude = bactéries, gpe externe = eucaryotes + archaea Avec le seuil, vous me dites : groupe d'étude = bactéries + eucaryotes (soit) - multiple : AB-B : Nb d'aa manquant ? cohérent avec blast ? - phylo : Groupes taxo [bactéries] sur arbre pas pertinent, vous auriez pu etre plus précis. Votre conclusion : origine taxo = bactéries ==> OUI, mais c'est trop vague, car dans votre cas, vous auriez pu faire une assignation taxo plus précise, une 2ème phylogénie resserrée sur les bactéries (groupe d'étude = bactéries, gpe externe = eucaryotes + archaea) : dans ce cas vous auriez pu définir un sous-groupe taxo bactérien et voir d'éventuels HGT. HGT entre bactéries et eucaryotes : NON, une autre hypothèse ? - symbole de gène non renseigné, alors que vous pouviez ⇒ pas fait !
bien cordialement,
Bénédicte Wirth
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