Bonjour,
lors de notre annotation, nous avions choisi les bactéries comme groupe d'étude, et les archaes
comme groupe extérieur.
Dans le groupe extérieur, nous n'avons choisi que 3 séquences, d'halobactéries, car ils avaient des
scores = ou < au groupe d'étude.
Or, lors de la correction, il est dit :Pourquoi avoir choisi 3 séquences d’halobactéries seulement pour le groupe extérieur ?
Est ce que cela signifie qu'il faut justifier le fait de ne prendre que ces 3 séquences, ou faut-il en prendre plus?
Parce que si on en prend plus, on est obligé de tomber dans des scores plus bas, ce qui cause problème lors de l'analyse de
l'alignement multiple...
Qu'en pensez-vous?

Oui il faut expliquer pourquoi seulement 3 séquences ont été choisies.
Apparemment vous avez la réponse.

Céline Brochier