Bonjour.
Je me demandais comment on pouvait trouver le groupe interne et externe d'après ma séquence. Pour ma part, je dirais par intuition, que le groupe d'étude serait l'ensemble des proteobactéries et le groupe externe serait les spirochetes et bactéries.Est ce correct et si oui, comment peut on correctement le justifier?

Merci.

Bonjour,
Je ne peux pas répondre à votre question tant que vous ne mettez pas dans les résultats bruts le rapport taxonomique complet. En effet, avec seulement ce qu'il y a là, nous n'avons pas assez d'informations pour définir le groupe d'étude (et donc le groupe extérieur).
J'ai fait le BLAST à 5000 de mon côté, et tout ce que je vous dirais là, c'est que ce ne sont pas les bons groupes d'études et extérieurs.
De plus, si votre groupe d'étude est les protéobactéries, votre groupe extérieur est l'ensemble des bactéries sauf les protéobactéries (et pas spirochètes + bactéries comme vous l'avez écrit. De plus les spirochètes font parties des bactéries).

Bonne continuation.