Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Sujet de discussion: croisement avec INTERPRO

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croisement avec INTERPRO
meljess
18 Apr 2011 15:16
Contribution non évaluée
Bonjour
Dans votre correction vous écrivez "Alignement multiple/Analyse: Absence d'analyse de l'alignement multiple (régions conservées/divergentes, cohérence avec domaines INTERPRO...)"
sachant que nous n'avons pas de domaine dans interpro (à part un domaine noipr transmembranaire) qu'entendez vous par cohérence avec domaine interpro?

Merci
Mélanie et jessica
E_Meglecz_11
18 Apr 2011 16:17
Maître de jeu
Bonjour,

Comme c'était expliqué au TD, il y a des commentaire généraux, où un ou plusieurs des points entre les parenthèses vous concernent.  Donc, dans votre cas la référence au domaine Interpro n'est pas important, par contre vous pouvez analyser la position des régions conservées. Comment interprétez-vous la présence des grands gaps dans votre ORF?

Cordialement,

EMese Meglecz