Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: comment faire le BLAST

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comment faire le BLAST
samiahafsoi
13 Feb 2011 17:56
Contribution non évaluée
Bonjour,
En fait on voulait faire le BLAST, et on a trouvé 6 séquences homologues au lieu de 10.
Est ce qu'on prend ces 6 séquences pour faire l'homologie ou il faut absolument les 10 séquences?  

Merci d'avance.

samiahafsoi
C_Brochier_11
13 Feb 2011 21:22
Maître de jeu
Bonsoir,

Vous pouvez faire une analyse phylogénétique dès lors que vous avez plus de 4 séquences. Par ailleurs, l'analyse de l'alignement multiple (même si il y a peu de séquences) est importante et peut vous renseigner.
Si vous avez trouvé ces homologues dans la banque de séquences nr, vous pouvez compléter l'échantillonnage de vos séquences avec des séquences homologues issues de la banque environnementale.

Céline Brochier