Bonjour,
Dans ma séquence 2 GOS_809020, c\'est au sujet des domaines protéiques. Pour un domaine IPR on doit lister le domaine issu d\'une autre banque de donnée qui est le plus long ou qui a la e-value la plus petite?
Sur la correction vous dite \"qu\'elle est la répartition trouvée avec interproscan\" c\'est-à-dire de quel organisme la séquence pourrait être issue?

Merci sweet

Bonsoir,

Je ne comprends pas la question : "Pour un domaine IPR on doit lister le domaine issu d\'une autre banque de donnée qui est le plus long ou qui a la e-value la plus petite?"

"Sur la correction vous dite \"qu\'elle est la répartition trouvée avec interproscan\" c\'est-à-dire de quel organisme la séquence pourrait être issue? " << Non, on vous demande de décrire la répartition taxonomique du domaine considéré. Dans l'idéal vous devez comparer cette répartition taxonomique à celle observée par blast.

Cordialement,

Céline

pour choisir le domaine que l'on liste dans l'annotathon on le choisi plutôt parce qu'il a une e-value basse ou parce qu'il est le plus long?

Merci

Bonjour,

Il n'y a pas de règle absolue. Vous devez réfléchir, tenir compte des deux informations, faire une analyse comparative des fonctions des différents domaines, les comparer à celles observées par blast...

Cordialement,

Céline Brochier