Bonjour, 

Etant donné que nous avons beaucoup d'ORF (16), nous chercherchons à savoir lesquels sont des faux positifs via BLAST (recherche via BLASTtp).

Devons nous vérifier qu'il y ait des homologues avec la banque SWISSPROT ET NR ou que via SWISSPROT ? (Nous avons trouvé des homologues de certains ORF avec NR mais pas avec SWISSPROT) Que devons nous en conclure ?

Merci de votre compréhension,

Cordialement.

Bonjour,

L'objectif ici est de déterminer si dans les banques de données, il existe des homologues aux ORFs prédites à partir du fragment d'AND que vous étudiez.

Il est donc nécessaire de faire la recherche dans les banques de données les plus exhaustives possibles, donc plutôt dans NR.

Lorsque vous vous intéresserez à la fonction de la protéine codée par l'ORF la plus longue, alors vous vous tournerez vers SWISSPROT en première intention.

Cordialement,

Céline Brochier