Bonjour, lorsque j'enracine mon arbre les valeurs de support de branches. J'ai  changé l'affichage en mettant les longueurs de branches, elles s'affichent mais pour les valeurs de support de branche rien a faire, même en lançant phylogeny plusieurs fois. Sauriez-vous comment je peux faire ?

J'aurais une autre question par rapport à mon groupe extérieur. J'ai pris comme groupe d'étude les Pelagibacterales, mon groupe extérieur sera donc les autres Alphaproteobacteria. Est-ce que je le nomme "autres Alphaproteobacteria" ou est-ce que je dois citer tous les ordres ? Enfin, lorsque je fais mon arbre, dois-je les représenter d'une seule couleur ou une couleur différente pour chaque ordre ?

Merci beaucoup

>Bonjour, lorsque j'enracine mon arbre les valeurs de support de branches...mais pour les valeurs de support de branche rien a faire, même en lançant phylogeny plusieurs fois. Sauriez-vous comment je peux faire ?

==> Cela a été mentionné à de maintes reprises : effectivement bug de Treedyn ! On perd les valeurs de support de noeuds dès qu'on manipule l'arbre.

C'est pour cette raison que vous devez utiliser l'enracinement avec l'outil local pour avoir les valeurs de support de noeuds sur l'arbre.

>Est-ce que je le nomme "autres Alphaproteobacteria" ou est-ce que je dois citer tous les ordres

==> Les 2 : vous pouvez effectivement nommer votre groupe "autres Alphaproteobacteria", mais dans votre analyse vous devez donner votre explication et citer les groupes plus précisément ou au moins leur nombre.

>lorsque je fais mon arbre, dois-je les représenter d'une seule couleur ou une couleur différente pour chaque ordre ?

==> CF règles du jeu : il faut effecitivement utiliser des couleurs. Si vous pouvez mettre en évidence des clades bien distincts dans le groupe externe, oui, ca peut etre interressant, mais si tout est mélangé, ca n'a pas beaucoup d'intérêt.

Bon Travail,

BW