Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Thread subject: Déterminer la fonction de l'ORF

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Déterminer la fonction de l'ORF
sheina
16 Apr 2019 12:16
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Bonjour,

J'ai du mal a comprendre pourquoi mon premier Blastp me donne des résultats aussi longgggss alors que j'ai précisé 10 alignements comme dans la video ! Pour la deuxième ça ne m'a pas posé problème et ça me semble aussi long que dans la vidéo.

Ai-je fait une erreur de paramétrage ou bien c'est juste?

 

Cdlt

Sheina

Meglecz18CTES
16 Apr 2019 18:14
Game master

Bonjour Sheina,

Vos résultats de BLAST dans le champ ‘Résultats bruts’ me semblent bien.
Vous avez tous les descriptions des hits dans un format tableau, suivis par quelques alignements à deux.
Avoir beaucoup des hits dans le BDD nr et relativement peu dans Swissprot est typique, car Swissport est une petite BDD.


Je ne vois pas de problème.
Emese Meglecz

 

sheina
16 Apr 2019 23:26
Non evaluated contribution

Bonsoir

Je vous remercie!!

 

Cdmt