Nous avons soumis notre premier lot à la correction, et le correcteur nous a écrit:
\"-conclusion:taxonomie:Pas de comparaison des infos du taxonomy report avec les informations taxonomiques obtenues avec interpro\"
Nous ne comprenons pas très bien le sens de cette phrase car pour nous Interpro permet de faire des recherches de domaine.
De plus la recherche de domaine avec Interpro, ne donne pas de domaine fonctionnel, dans notre cas.
Où trouve-t-on les informations taxonomiques dans Interpro?

Merci

Bonjour,

La banque interpro vous permet effectivement de rechercher des domaines fonctionnels.
Chaque domaine est associé à un descriptif (fiche) qui contient un grand nombre d'informations, dont des informations fonctionnelles mais aussi des informations taxonomiques (cad dans les protéines de quels organismes trouve-t-on ce domaine).
Ces informations sont à croiser avec les infos taxonomiques issues de la recherche par blast.

De même les informations fonctionnelles issues d'interpro doivent être croisées avec celles du blast.

Cordialement,

Céline Brochier

Rebonjour,
Merci pour la rapidité de votre réponse!!
Pour notre séquence, nous n'avons pas de domaine fonctionnel, donc pas de fiches descriptives!!
Ou alors, faut_il que l'on regarde les domaines de la séquences la plus proche de la notre??
Merci

Effectivement vous n'avez pas de domaine fonctionnel détecté par inter pro.
Par contre vous avez un commentaire qui vous dit que lors du lancement du blast un domaine fonctionnel est détecté. Essayez de trouver des infos de ce côté là (il suffit de cliquer sur les images des domaines détectés pour accéder aux fiches).