Bonjour Madame,

Sous mon arbre, vous trouverez le lien ncbi de l'article, dans lequel il est fait mention de Basal subgroup, PO subgroup, VAAP subgroup et Enterobacter subgroup.

Je pense que PO c'est pour Pseudomonadales et Oceanospirillales. De même que VAAP c'est pour Vibrionales, Alteromonadales, Aeromonadales et Pasteurrales.

Ils disent aussi que Orbales est spécifique des abeilles et est frère des Enterobacter.

Bien à vous !

Laetitia.

Bonjour Laetitia,

Cet article montre bien les difficultés et les incertitudes existant dans la taxonomie/phylogénie des bactéries.
Selon la figure 3 le groupe PO contient des Pseudomonadales, et les Oceanospirillales mais aussi certains Alteromonales. Ce qui est aussi important, mais n’est pas traité dans le cours, que les ordres ne sont pas nécessairement monophylétiques.
Pour simplifier votre travail, partez sur l’idée qu’un taxon donné est monophylétique. Si vous trouvez une contre-indication dans votre arbre, la polyphylie d’un groupe sera une explication potentielle. La référence à un article scientifique est un gros plus.

Bon travail,
Emese Meglecz

Merci Madame !

Mon anglais n'est pas si mauvais que ça alors ! C'est ce que j'avais compris !

En ce qui concerne l'Alteromonales de mon arbre, il a une insertion très élevée. Je suppose donc qu'il fait bien partie des ces Alteromonales compris parmi les PO. Seulement si ça se trouve avec une autre séquence je ne l'aurais pas eu ici mais bien dans les VAAP ...

Bien à vous !

Laetitia