reneejenni
24 Apr 2011 22:47
Non evaluated contribution |
Bonjour,
Je vous envoie un extrait descriptif de mon rapport taxonomique:"Nous retrouvons des scores qui vont de 343 à 289 pour les g-proteobacteria, de 288 à 287 pour les enterobacteria puis une zone de mélange de g-proteobacteria et enterobacteria qui va de 287 à 257; puis des a et b et d-proteobacteria apparaissent jusqu' au score 217; puis nous avons des bacteria, des firmicutes, des aquificales, des GNS bacteria, un hydrozoana( de score 219) .Le dernier score est de 204 et est pour une série de firmicutes.
Les scores sont très proches les uns des autresà partir des entérobacteria. Il y'a une continuité sauf pour l'hydrozoans."
comment définir un groupe d'étude quand les scores sont aussi continus? Aucun groupe ne se distingue des autres.
Par ailleurs, pour faire l'alignement multiple, ayant fait deux blast,p et blastx, dois-je inclure les homologues des deux blast ensemble?
Merci
Renéejenni
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