Annotathon fr

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L'Annotathon est un environnement Internet pour l'apprentissage des méthodes bioinformatiques d'analyse de séquence. Les participants ajoutent à leur panier de séquences des fragments d'ADN génomique environnementaux issus de différentes océans (projet Global Ocean Sampling de Venter et al.) et les annotent. Les analyses comprennent la détection de régions codantes, la recherche de séquences homologues dans les banques de séquences, l'identification de domaines protéiques conservés ainsi que la construction d'arbres phylogénétiques.

L'Annotathon est conçu pour gérer de larges cohortes de participants (dénommées équipes, par exemple des promotions d'étudiants) encadrés par des enseignants. Chaque séquence annotée par chaque participant est examinée, commentée et évaluée par les enseignants à deux reprises, permettant aux participants de se corriger et d'améliorer la qualité de leurs analyses. Après la clôture d'une session, les participants peuvent recevoir une évaluation quantitative pour l'ensemble de leurs annotations.

Liens utiles

Accès à l'Annotathon

Principe et manuel de l'utilisateur: Annotathon

Guide de l'annotateur: Annotathon: foire aux questions

Phylogénie: Fileicon-pdf.png principes de sélection des groupes d'études et extérieurs Info_circle.png

Les fiches Annotathon publiques: Metagenes

Auteurs

L'Annotathon a été conçu par l'équipe pédagogique de bioinformatique du Département de Biologie de la Faculté des Sciences de Luminy (Université de la Méditerranée): Pascal Hingamp, Céline Brochier, Emmanuel Talla, Daniel Gautheret (maintenant à Orsay), Denis Thieffry & Carl Herrmann. Le logiciel est développé par Pascal Hingamp.

Langues

L'Annotathon est actuellement disponible en français et en anglais. Les traducteurs dans d'autres langues sont les bienvenus! Tous les termes spécifiques aux langues sont externalisés dans un fichier (actuellement environ 500 termes et phrases). L'expérience montre qu'une traduction complète ne devrait pas prendre plus d'une dizaine d'heures (y compris la traduction des "Règles du Jeu").