Forum "Fonctions molÚculaires & Processus biologiques"

Thread subject: détermination de la fonction et du processus

[ Return to forums ]
détermination de la fonction et du processus
oralblandine
21 Apr 2010 10:12
Non evaluated contribution
Bonjour,
je vous ai expliqué qu'il m'étais difficile de déterminer la fonction molécuculaire et le processus biologique d ma séquence car elle possède un domaine conservé de type vWA like et que ce domaine comprends différentes fonctions importante pour la cellule : comme par exemple la signalisation, l'adhésion ....Cela comprends environ une dizaines de rôles. Vous me proposez d'essayer de voir si ma séquence n'est pas plus spécialisée dans l'un de ces rôles important pour la cellule. Mais sur quoi dois-je me baser pour arriver à déterminer cela? Quelles techniques employer? Je ne vois vraiment pas comment faire pour éliminer certains rôles et pas d'autres. De plus au niveau des fonctions et des processus donnés dans l'annothaton il y en a bien qui pourraient faire l'affaire mais cela ne montre pas la diversité des fonctions du domaine vWA like (qui couvre plusieurs fonctions à lui seul).
Merci d'avance pour votre réponse.
c_petitjean_10
21 Apr 2010 10:47
Game master
Bonjour,

Je ne peux pas vous en dire beaucoup plus que dans ma réponse précédente.
Relisez la, en entier.
Je ne vous dis pas que vous devez absolument choisir une fonction, je vous indique des pistes que vous pouvez essayer pour trouver une réponse, si il y en a une claire.

Une petite indication, par exemple, si vous avez défini une origine taxonomique à votre séquence, les annotations fonctionnelles des séquences parentes les plus proches de la votre peuvent peut être vous aider à cibler une annotation fonctionnelle pour la votre.

Encore une fois, vous faite un travail sur des séquences inconnues, il se peut que vous rencontriez des cas imprévus, dans ce cas, justifiez vos decisions!
Une absence de réponse (très) bien justifiée est meilleure qu'une réponse fausse.
More