Bonjour,
nous avons un petit souci concernant la fonction moléculaire et le processus biologique de notre domaine. En effet notre domaine est celui d'une alanine racemase. InterPro Scan n'affiche aucuns termes GO, nous avons donc chercher dans les fiches des séquences issues des blastp (contre nr et swissprot) mais pas de résultats sur la fonction et le processus. Nous avons donc chercher sur internet et nous avons trouver que l'alanine racemase est une isomérase qui intervient dans le métabolisme de l'alanine (plus généralement des acides aminés et de ses dérivés). nous aimerions donc savoir si l'on doit conclure que le processus biologique est le métabolisme des acides aminés ou pas? doit on faire la même chose pour la fonction moléculaire et conclure qu'il s'agit d'une isomérase?
merci d'avance pour votre réponse
binome Opale

Ces enzymes sont assez connues ... tu as d'ailleurs trouvé assez vite sa fonction sur internet... ce cas est souvent arrivé cette année. Je pense que tu peux raisonnablement conclure sur "une isoméraseintervenant dans le métabolisme de l'alanine".De meme que pour la fonction biologique :ce sont des isomérases impliquées dans la synthèse des acides aminées.
J'espere que ça va t'aider.
Macchi Magali

merci d'avoir répondu, çà me rassure de voir que quelqu'un pense la même chose que moi
j'attends l'accord de mon binôme ensuite je pourrais enfin envoyer ma séquence pour la seconde correction.
j'ai le même problème avec ma dernière séquence, j'ai réussi à déterminer une fonction (transférase) mais pas le processus biologique,étant donné que cette fonction est très répandu je pense faire des recherches plus poussées pour déterminer un processus biologique.
encore merci pour ta réponse.

"nous aimerions donc savoir si l'on doit conclure que le processus biologique est le métabolisme des acides aminés ou pas? doit on faire la même chose pour la fonction moléculaire" Oui, oui, triple oui: c'est bien rare d'avoir le terme GO qui va bien présenté sur un plateau:) Le plus souvent, vous trouvez une définition, genre "racemase", charge à vous de trouver - et tous les moyens sont permis y compris GOOGLE & WIKIPEDIA - quels sont les meilleurs termes GO... Dans TOUS LES CAS, expliquez votre démarche pour choisir ces termes GO.