Forum "Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs"

Sujet de discussion: Choix de sequence

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Choix de sequence
Spoon
2 Nov 2023 16:34
Contribution non évaluée

Bonjour,

Je me redirige vers vous après avoir regardé les enregistrements des zooms auxquels je n'ai malheureusment pas pu assister. Comme Téhila, ma question était de savoir comment être sur d'avoir bien validé la séquence à annoter. 

Celle que j'ai commencé a analyser en détails me parait plutot cohérente en tereme d'arbre, de pourcentage de couverture et de longeur d'alignement etc. mais serait-ce possible que vous regardiez globalement mon travail afin de savoir si j'avance dans le bon sens.? 

Merci beacoup,

Bonne soirée 

Sarah Spingarn 

Meglecz23-4CTES
3 Nov 2023 8:18
Maître de jeu

Bonjour,


D’après vos résultats rapides, votre ORF semble être bien. Faites bien attention au choix de groupe d’étude et extérieure, et en conséquence le choix des séquences homologues et n’oubliez pas à ajouter l’ORF dans les analyses phylogénétiques.

 

Bon travail,
Emese Meglecz